一層按 埃及 古代歷史發展順序展出，在這裡可以看到從古王國時期（公元前2686年至公元前2181年）到公元五、六世紀的 羅馬 統治時期的珍貴文物。古王國時期的展品以 孟菲斯 為中心的北 埃及 王墓出土雕像為主，有 卡夫 勒王座像，盤腿書記坐像，拉赫梯普國王及王妃民費雷特坐像等。後者為石灰岩著色像，仍保持了鮮艷的色彩。中王國時期，木雕逐漸代替石雕。陳列的彩色木雕士兵像、送祭品人像等極為精緻。新王國時期，尤其是第十八王朝的年輕法者圖坦卡蒙時期（公元前1584年至公元前1341年），是 埃及 的繁盛時代，除陳列有吐特摩斯三世、拉美西斯二世、阿孟霍特普四世等像外，還有跪像、蹲坐像等小雕像。 希腊 、 羅馬 時期的展品有融合 希腊 寫實風格的不同雕刻。
二層是專題陳列室。有棺木室、木乃伊室、珠寶室、繪畫室、隨葬品室、史前遺物室、圖坦卡蒙室、紙草文書室等。圖坦卡蒙室陳列有1700餘件出土文物。其中圖坦卡蒙法老木乃伊的“黃金面罩”、“黃金棺材”、“黃金寶座”等，可與世界上任何一個博物館中最值得誇耀的文物媲美。尤其是“黃金面罩”，是用金板依照國王生前容貌打造，鑲滿紅寶石，額上還塑有象徵上下 埃及 統治者的兀鷹和眼鏡蛇。這些光輝燦爛的金製品，是古代 埃及 財產的豐富和法老權力巨大的充分體現。二層西南角的木乃伊陳列室是 埃及 博物館最吸引人的地方。裡面安放有20餘具 埃及 歷代法老及其后妃們的木乃伊。木乃伊是幾千年前經過製作的乾屍。在存放木乃伊的人形棺木的蓋上和內部，繪有死者的守護神或經文。如阿斯特姆卡布的彩色木棺棺蓋，高205釐米，眼睛、眉毛用琺琅鑲嵌，給人以雍容華貴之感。 埃及 博物館存放的木乃伊，有的已有3500多年的歷史，但仍保存完好，有的還可以清楚地看到頭髮和腳指甲。其中保存最好的是新王國第十九王朝的拉美西斯二世（約公元前1317年至公元前1251年）的遺體。拉美西斯二世在 埃及 歷史上，第一個與外敵赫梯人之間締結了 和平 條約，所以安放拉美西斯二世遺體的展室叫“戰爭與 和平 展覽室”。
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